遗传工具可帮助识别1型糖尿病的细胞元凶

研究结果发表在2021年5月19日的在线《自然》杂志上。
1型糖尿病是一种复杂的自身免疫性疾病,其特征是胰岛素分泌性胰岛β细胞的损伤和丧失以及随后的高血糖症(高血糖),对身体造成损害,并可能引起其他严重的健康问题,例如心脏病和视力失利。1型糖尿病比2型糖尿病少见,但其患病率正在上升。美国疾病预防控制中心预测,到2050年,将有500万美国人患有1型糖尿病。目前,没有治愈方法,只有疾病控制方法。
对1型糖尿病的机制,包括如何引发自身免疫,了解甚少。由于它具有很强的遗传成分,因此近年来进行了许多全基因组关联研究(GWAS),研究人员比较了具有相同疾病或状况的人的整个基因组,以寻找可能与之相关的遗传密码上的差异。那种疾病或状况。
在1型糖尿病的情况下,已在基因组的非编码区很大程度上发现了已确定的高风险变异体。在《自然》研究中,加州大学圣地亚哥分校医学院儿科学系助理教授,资深作者凯尔·高顿(Kyle Gaulton)博士及其同事将GWAS数据与外周血和胰腺细胞类型的表观基因组图谱进行了整合。表观基因组图谱详细介绍了如何以及何时在细胞中打开和关闭基因,从而确定了对特定细胞功能至关重要的蛋白质的产生。
具体来说,研究人员进行了迄今为止最大的1型糖尿病GWAS,分析了520,580个基因组样本,以确定69个新的关联信号。然后他们绘制了胰腺和外周血细胞类型中的448,142个顺式调控元件(基因中或附近的非编码DNA序列)。
“通过结合这两种方法,我们能够确定疾病变体的细胞类型特异性功能,并发现胰腺外分泌细胞在1型糖尿病中的预测因果作用,我们能够通过实验进行验证,” Gaulton说。
胰腺外分泌细胞产生分泌到小肠中的酶,这些酶可以帮助消化食物。
医学博士,加州大学圣地亚哥分校医学院儿科和细胞与分子医学系教授,儿科糖尿病研究中心主任迈克·桑德(Maike Sander)医学博士说,这些发现代表了对理解1型糖尿病病因的重大飞跃。 。她将这项工作描述为“具有里程碑意义的研究”。
“这意味着外分泌细胞功能障碍可能是疾病的主要诱因。这项研究提供了遗传路线图,从中我们可以确定哪些外分泌基因可能在疾病发病机理中起作用。”
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